Download Troubleshooting the GFP-tagging gene knockout (GGKO) method for

Appendix B – UFRs and DFRs
Legends
 Highlighted Yellow: Forward Primer Binding Site.
 Highlighted Green: Reverse Primer Binding Site.
 Underlined: Signal Peptide Sequence.
AvrLm6
UFR:
TTACAATCTAAAGTTAAATAAGCCCTCTTGTGTTAATTATTCTCGGTCAAATAGATACA
TTAGGTCTCACAATCTAAAGTTAAATAAGCCCTCCTATGTTAATTGTTCTCGGTTAAAT
AGATACATTAGGTCTTACAATCTAAAGTTAAATAAGCCCTCCTGTGTTAATTATTCTCG
GTCAAATAGATACATTAGGTCTCACAATCTAAAGTTAAATAAGCCCTCCTATGTTAATT
ATTCTCGGTCAAATAGATACATTAGGTCTCACAATCTAAAGTTAAATAAGCCCTCCTAT
GTCAATTGTTCTCGGTTAAATAGATACATTAGGTCTCACAATCTAAAGTTAAATAAGCC
CTCCTAGCACTAAACAAGCTAGTAGTAACCTGAACTAATCTAAATTATTTCTAGCTTTA
AACTTTCATCGCATTTAATCTTCAATTTGTCTGTTCAAGTTATGGATATATATTAAACTT
GATCCCACATATTCACTTCACATTCTTAACAATCTATAAACAATCTTCGCACGTTCCAA
AGCCCTATTTATAACCTAGCATGGTGATTTACCTACCCCTATACCTTCTCGTCTTAGGA
ATAGCGTACGTGTCTCTCTTAACGCTACACTAAACGCACTTTTAAACCCAATCTAGGAC
TACCACGATTAGTCAGCCTCATTTGTTGTGCGCCTGCGAGAGC
DFR:
GCCTTGGCTGTATTGCTACCACTACGGTTCAAAACTGGTTTACAGTTGCCATATTTATCT
AAAGTAGACTAAGAAGTAGCTTAGGTAGAAGAAGTAAACCTAAATAGGGTTTACTATA
CTATGTATTCTACTTTTACTTCTACCTCTATTAATCTACTAGTTTCCTACTAACTATTTAA
GTATTTTACCCCTCCTTTCTTTAATCTTCTTTACCACCTCTATTACCACCTCTACCACTAC
CTCTACCACCACCTCTATCACCACCACCACCTAAACAACCTCTATTATCACCACCTCCT
ATTAGTAAAAATATTTAAACTTATTATTATGTTATATATGCGTATAGCATGAAGCTAAT
CTTCTCTACCC
Full Gene UFR:
ATGGTGATTTACCTACCCCTATACCTTCTCGTCTTAGGAATAGCGTACGTGTCTCTCTTA
ACGCTACACTAAACGCACTTTTAAACCCAATCTAGGACTACCACGATTAGTCAGCCTCA
TTTGTTGTGCGCCTGCGAGAGCGGTAGACGTGATGGAGTTGACGATACCCGAACTTTG
AAAGTTGTCAAAGGCACTGGAGGCAGATTTGTTTTTAGTATGTTACTAGATACAACCTA
TCCTAAAATTTGCTAACACTCTAAGGCAGCAGATATTGGACAAAAGCCGAAGGCGCTC
CGCACGAAGGCAACTATGTACTAGATCTGCTTCCTTTAATATATTCACTTTTTAACGCG
TTCTAGGCTCATGCTATAAACGGCACTATTACGAAAAAAGGGACTAACATCCAAGCCC
ATGACGATGGTCTCATCGGCGGAGAGGAGATGAACAGTTTATGTCCTGAACATTCCAC
TTGCTTCTCGCCTAATCTTAAGGCCAAATCGACCCACTCCTGCGGTCCAGACGGGAAAT
ATGGGTGCGTCAGCGCTTGGTTATCTGTTAACTGGGAAGGACAAATCCAA
Full Gene DFR:
TAGATTTAGCGGAGAACGTCGTTTATGCCGCTGAATTTGGGTGCCTAGCATAGACTGTA
CTTGTGAAGAGCTCAGCTTGCTAGATAAGTACTTAGCGTGCTTGGTCGTTACCTATCAT
ACTCTACGCATCCAGAAGACTAGCCATTGTCTTGTGTATAGTGTAGTAAGGGACATTTC
CACCCTCAAGCTAGCCCGTCTCAAGTGCGGCGAACCCAACTCTAGGTAGCCTAACAGG
TATCTAACGTTGAATCTAGCGGCTTTATTATTTGCCTAGCATTTTCGCGAGTTCCTTAAT
TATGTAGATAGAACTTTGACGAAAAGTGCTAATTAACGCAAGGTCGCGTAGCATTGAA
CCTAAGCAGTCAAGAAATGACCCTAGATGTAAGATCGAAACGGAAAGGTTAGTGCAG
CCTATCCACTGTTAGCCTGTGCTCCGTTCGTCGATAATTTGTGGT
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