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Contents
1 Introduction
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2 Three Dimensional Tree Models
2.1 The Role of Three Dimensional Tree Models . . . . . . . . . . . .
2.2 Examples of Models . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
2.3 Applications . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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3 Programming Guidelines
3.1 Background . . . . . . . . . . . . . . .
3.2 Using C++ . . . . . . . . . . . . . . .
3.2.1 C programmers . . . . . . . . .
3.2.2 Learning C++ . . . . . . . . .
3.3 Programming Style . . . . . . . . . . .
3.3.1 Typographical Issues . . . . . .
3.3.2 Comments and Documentation
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4 Getting Started with LIGNUM
4.1 Getting Lignum . . . . . . . . . . .
4.2 Compiling LIGNUM . . . . . . . .
4.3 Makefiles for LIGNUM . . . . . . .
4.3.1 Predefined Macros . . . . .
4.4 Running LIGNUM . . . . . . . . .
4.4.1 Initialization of the Tree . .
4.5 Visualizing Results . . . . . . . . .
4.5.1 The Visualization Program
4.5.2 MineSet Program . . . . . .
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5 The
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Design of LIGNUM
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Units of LIGNUM . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 16
Program Architecture . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 18
Algorithms and Methods . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 20
6 Algorithms
6.1 ForEach . . . . .
6.2 Accumulate . . .
6.3 AccumulateDown
6.4 PropagateUp . .
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