Download User Manual Version 1.1 - Computational Infrastructure for

Contents
1
Introduction
5
2
History
2.1 Updates for Ver 1.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
5
6
3
Acknowledgements
7
4
Citation
7
5
Model of Simulation
5.1 Governing equations . . . . . . . . . . . . . . . . .
5.2 Spherical harmonics expansion . . . . . . . . . . . .
5.3 Evaluation of Coriolis term . . . . . . . . . . . . . .
5.4 Boundary conditions . . . . . . . . . . . . . . . . .
5.4.1 Non-slip boundary . . . . . . . . . . . . . .
5.4.2 Free-slip boundary . . . . . . . . . . . . . .
5.4.3 Fixed rotation rate . . . . . . . . . . . . . .
5.4.4 Fixed homogenous temperature . . . . . . .
5.4.5 Fixed homogenous heat flux . . . . . . . . .
5.4.6 Fixed composition . . . . . . . . . . . . . .
5.4.7 Fixed composition flux . . . . . . . . . . . .
5.4.8 Connection to the magnetic potential field . .
5.4.9 Magnetic boundary condition for center . . .
5.4.10 Pseudo-vacuum magnetic boundary condition
6
Installation
6.1 Library Requirements . . . . . . . . . . . . . . . . .
6.2 Known problems . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
6.3 Directories . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
6.4 Doxygen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
6.5 Install using configure command . . . . . . . .
6.5.1 Configuration using configure command
6.5.2 Compile . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
6.5.3 Clean . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
6.5.4 Install . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
6.6 Install without using configure . . . . . . . . . . . .
6.7 Install using cmake . . . . . . . . . . . . . . . . . .
2
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
9
9
11
11
12
12
12
12
13
13
13
13
14
15
15
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
16
16
16
17
18
18
18
19
20
20
21
22