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Contents
xi
9.5
Genetic groups . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 150
9.6
Reading a user defined inverse relationship matrix . . . . . . . . . . . 152
The example continued . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 153
10 Tabulation of the data and prediction from the model
154
10.1 Introduction . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 155
10.2 Tabulation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 155
10.3 Prediction . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 156
Underlying principles . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 156
Predict syntax . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 158
Examples . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 166
11 Functions of variance components
167
11.1 Introduction . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 168
11.2 Syntax . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 168
Linear combinations of components . . . . . . . . . . . . . . . . . 168
Heritability . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 169
Correlation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 170
A more detailed example . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 171
12 Command file: Running the job
173
12.1 Introduction . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 174