Download CEQ Sequencing Troubleshooting

Transcript
SOMMAIRE
Section I : Diagnostic général
Données brutes – Bon signal de données brutes
Profil de courant – Profil de courant normal
2
2
3
Section II : Détecter un problème sur le CEQ™
A- Est-ce un problème lié à l’instrument ou à la chimie ?
1) Diagnostic à l’aide de l’ADN test pour séquençage (réf. 608070)
2) Validation des composants du kits DTCS de séquençage
3) Les réactifs de l’utilisateurs sont suspects
4) Le problème vient-il de la matrice ou de l’amorce
4
4
4
5
5
5
B- Problèmes de courant
1) Injection électrocinétique – théorie
2) Diagnostiquer les problème de courant : à quoi doit ressembler le profil de courant
a) Un courant qui décroît graduellement
b) Un courant irrégulier ou un courant qui s’effondre
c) Les 8 capillaires présentent un même courant irrégulier
6
6
6
6
7
10
C- Problèmes de données brutes
1) Types de problèmes de signaux de données brutes
2) Diagnostiquer les problèmes d’intensité de courant
3) Les causes d’un faible signal de données brutes
a) Faibles données brutes dues à un manque de matrice
b) Faibles données brutes dues à des problèmes d’amorces
i) Quantité et qualité de l’amorce
ii) Conception de l’amorce (design)
c) Faibles données brutes dues à une formamide de mauvaise qualité
d) Faibles données brutes dues à l’utilisation d’eau en remplacement du SLS
e) Faibles données brutes dues à une injection insuffisante d’échantillon
f) Faibles données brutes dues à la qualité de l’huile minérale
g) Faibles données brutes dues à des problèmes de thermocyclage
4) Données brutes de fluorescence trop élevées
5) Les phénomènes d’insertion
a) Les insertions dues aux amorces n-1
b) Les insertions dues à un mélange de matrices, un mélange d’amorces ou
un mauvais appariement d’amorce
6) Bruit de fond élevé
11
11
11
11
11
13
13
13
15
15
16
17
17
19
20
20
Section III : Tableau d’aide rapide au diagnostic
24
Section IV : En résumé
28
-1-
21
23