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Contents
1 Introduction
2
2 Installation
2.1 Installation Instructions . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
2
2
3 Instructions
3.1 User Interface Pages . . .
3.1.1 Main Page . . . . .
3.1.2 Create Data Struct
3.1.3 Find Amplicons . .
3.1.4 BP Filter . . . . .
3.1.5 BP Convert . . . .
3.1.6 Plot Data . . . . .
3.1.7 Write TXT . . . .
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4 Methods
4.1 Filtering . . . . . . . . . . . .
4.2 k -means Clustering . . . . . .
4.3 Dynamic Programming . . . .
4.4 Filtering according to basepair
5 Summary
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