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Contents
1 Introduction
1.1 System Requirements
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
2 Installation and Execution Instructions
2.1 Installation . . . . . . . . . . . . . . . .
2.1.1 Unpackaing the Distribution File
2.1.2 Compiling the Package . . . . . .
2.1.3 Execution Instructions . . . . . .
2.1.4 Running Built-in Examples . . .
2.1.5 Typical Running Time . . . . . .
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3 Input and Output
3.1 Input . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
3.2 Output . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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4 Examples
4.1 ZDPlasKin Examples . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
4.2 Global Kin Examples . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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Acknowledgements
11
A PumpKin Algorithm
A.1 Basic Definitions . . . . . . . . . . . . . .
A.2 Description of the Algorithm . . . . . . .
A.2.1 Initialization. . . . . . . . . . . . .
A.2.2 Branching-Points. . . . . . . . . .
A.2.3 Merging Pathways. . . . . . . . . .
A.2.4 Deletion of Insignificant Pathways.
A.2.5 Sub-Pathways. . . . . . . . . . . .
GNU General Public License
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