Download Validate Workflow User Manual

5 Visualizing the Validation
2
20
5.1
How to Use the Demonstrate R Package . . . . . . . . . .
20
5.2
How to Use Demonstrate on the DE . . . . . . . . . . . .
20
5.3
How to Use Demonstrate on Atmosphere
20
. . . . . . . . .
6 Acknowledgements
20
7 How to Interpret Performance Measures
20
7.1
AUC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
20
7.2
H. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
20
7.3
KS . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
20
7.4
TPR . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
20
7.5
FPR . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
20
7.6
Accuracy . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
20
7.7
MAE . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
20
7.8
RMSE . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
20
Validate: A Workflow for Evaluating GWAS/QTL Tools