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Contents
1 Introduction
2
2 Installation
2.1 Installation Instructions . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
2
2
3 Instructions
3.1 User Interface Pages . . .
3.1.1 Main Page . . . . .
3.1.2 Create Data Struct
3.1.3 Find Amplicons . .
3.1.4 Plot Data . . . . .
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4
. 4
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4 Methods
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4.1 Filtering . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 22
4.2 k -means Clustering . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 24
4.3 Dynamic Programming . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 25
5 Summary
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1