Download User Manual - AgesGalore

Contents
I
User Manual
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1 Introduction
1.1 Summary . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1.2 History . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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2 Using AgesGalore
2.1 Installation . . . . . . . . . . . . . . .
2.2 Running the software . . . . . . . . . .
2.2.1 Interactive mode . . . . . . . .
2.2.2 Script mode . . . . . . . . . . .
2.2.3 Server mode . . . . . . . . . . .
2.3 General workflow with AgesGalore
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3 List of commands
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4 Detector models
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4.1 General . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 17
4.2 Simple detector . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 18
5 Protocols
5.1 MASS
5.1.1
5.1.2
5.1.3
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Growth curve . . . . . . . . . .
Equivalent dose . . . . . . . . .
Recycling rations, fading rates
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6 Fitting routines
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6.1 Linear . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 22
6.2 Exponential saturation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 22
7 Grain segmentation
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7.1 Using ImageJ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 24
7.2 Using AgesGalore . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 29
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