Download ESCET Version 0.7 User Manual

Contents
1 Introduction
2
2 Command Scripts and Data Structure
2.1 Atom sets . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
2.2 Atoms . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
2.3 Residues . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
3
3
4
4
3 Identification of the rigid part of a macromolecule
3.1 Chorismat Mutase . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
3.2 Asparte Aminotransferase . . . . . . . . . . . . . . .
3.3 Tryptophan Synthase . . . . . . . . . . . . . . . . . .
3.4 Mersacidin . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
3.5 Ribosomal RNA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
6
8
10
14
16
20
4 Utilities
4.1 Manipulating pdb-files
4.2 SHELXL-related . . .
4.3 Analysing models . . .
4.4 Comparing things . . .
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
28
28
29
30
31
5 Tips and Tricks
5.1 General . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
5.2 ESCET-specific . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
33
33
34
6 Release Notes
36
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
1
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.