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CONTENTS
4
3.3
Zoom and selection in View Area . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
53
3.4
Toolbox and Status Bar . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
55
3.5
Workspace . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
58
3.6
List of shortcuts . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
59
4 User preferences and settings
62
4.1
General preferences . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
62
4.2
Default view preferences . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
64
4.3
Advanced preferences . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
67
4.4
Export/import of preferences . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
67
4.5
View settings for the Side Panel
68
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
5 Printing
71
5.1
Selecting which part of the view to print . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
72
5.2
Page setup . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
73
5.3
Print preview . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
74
6 Import/export of data and graphics
6.1
Standard import . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
76
6.2
Data export . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
80
6.3
Export graphics to files . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
87
6.4
Export graph data points to a file . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
92
6.5
Copy/paste view output . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
93
7 History log
7.1
Element history . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
8 Batching and result handling
III
75
94
94
97
8.1
How to handle results of analyses . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
97
8.2
Working with tables . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
99
Bioinformatics
9 Viewing and editing sequences
9.1
103
104
View sequence . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 104