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Contents
1. Overview
1.1. Specification . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1.2. Access . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1.3. File System . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
2. Quick Start
2.1. Access the HPC Cluster . . . . . . . . . . . .
2.1.1. From within the UOW campus . . . .
2.1.2. From the outside of UOW campus . .
2.2. Work at the HPC Cluster . . . . . . . . . . .
2.2.1. Being familiar with the environment .
2.2.2. Setup the working space . . . . . . .
2.2.3. Initialize the computational task . . .
2.2.4. Submit your job and check the results
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3. Software
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3.1. Software Installation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 17
3.2. Software Environment . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 17
3.3. Software List . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 19
4. Queue System
4.1. Queue Structure . . . . . . . . . .
4.1.1. Normal queue . . . . . . .
4.1.2. Special queues . . . . . .
4.1.3. Schedule policy . . . . . .
4.2. Job Management . . . . . . . . .
4.2.1. PBS options . . . . . . . .
4.2.2. Submit a batch job . . . .
4.2.3. Check the job/queue status
4.2.4. Submit an interactive job .
4.2.5. Submit workflow jobs . .
4.2.6. Delete jobs . . . . . . . .
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5. Utilization Agreement
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5.1. Policy . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 32
5.2. Acknowledgements . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 32
5.3. Contact Information . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 33
Appendices
35