Download Java CoG Kit Manual

4.6
5
Random number generation issues . . . . . . . . . . . . . . . . .
File I/O and Transfer
38
5.1
Introduction . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
38
5.1.1
Requirements for File Access and Transfer over the Grid .
38
5.1.2
GridFTP . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
38
5.1.3
GASS . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
39
5.1.4
Other file transfer mechanisms . . . . . . . . . . . . . . .
40
5.1.5
Security Requirements . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
40
Using GridFTP . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
40
5.2.1
GUI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
40
5.2.2
Unix Shell Scripts . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
42
5.2.3
Windows Batch Files . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
43
5.2.4
Java CoG Kit Shell . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
43
5.2.5
APIs . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
43
5.2.6
Differences between Java CoG Kit version 0.9.13 and 1.1a
46
5.2.7
FTP/GridFTP protocol features supported by the Java CoG
Kit . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
46
Limitations of the Java CoG Kit . . . . . . . . . . . . . .
47
Using GASS . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
47
5.3.1
GUI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
47
5.3.2
Unix Shell Scripts . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
47
5.3.3
Windows Batch Files . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
48
5.3.4
Java CoG Kit Shell . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
48
5.3.5
APIs . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
48
5.3.6
Limitations of the Java CoG Kit . . . . . . . . . . . . . .
51
5.2
5.2.8
5.3
6
37
Job Submission
52
6.1
Introduction . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
52
6.1.1
Gatekeeper . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
52
6.1.2
Job Manager . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
52
6.1.3
Batch and Interactive Jobs . . . . . . . . . . . . . . . . .
53
6.1.4
File Staging . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
53
Globus Resource Specification Language (RSL) . . . . . . . . . .
53
6.2.1
RSL Syntax . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
54
6.2.2
RSL in the Java CoG Kit . . . . . . . . . . . . . . . . . .
55
6.2
3