Download CLC Main Workbench

CONTENTS
5
6.2
Page setup . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 138
6.3
Print preview . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 139
7 Import/export of data and graphics
140
7.1
Standard import . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 140
7.2
Data export . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 145
7.3
Export graphics to files . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 147
7.4
Export graph data points to a file . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 151
7.5
Copy/paste view output . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 153
8 History log
8.1
154
Element history . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 154
9 Batching and result handling
156
9.1
Batch processing
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 156
9.2
How to handle results of analyses . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 159
10 Workflows
163
10.1 Creating a workflow . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 164
10.2 Distributing and installing workflows . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 168
10.3 Executing a workflow . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 172
III
Bioinformatics
173
11 Viewing and editing sequences
174
11.1 View sequence . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 174
11.2 Circular DNA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 183
11.3 Working with annotations . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 185
11.4 Element information . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 193
11.5 View as text . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 194
11.6 Creating a new sequence . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 195
11.7 Sequence Lists
12 Data download
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 196
200
12.1 GenBank search . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 200